马来西亚理科大学工程校区的校医院成立于1990年。起初，该学院位于霹雳州端洛的USM分院成立。其成立旨在为工程校区学生提供基本医疗服务。随着工程校区于2001年正式迁至槟城高渊，校医院也随之搬迁至现址，继续为全校师生提供全面的医疗支援。
目前，校医院由一支专业医疗团队组成，包括：
3 位医生
1 位牙科医生
2 位医疗助手
5 位护士
2 位药剂助理
1 位医学实验室技术员
2 位牙科助理
1 位医疗保健助理
1 位司机
校医院全面致力于预防、治疗、康复以及健康资源的管理。校医院所提供的服务涵盖了轻微疾病的门诊治疗、紧急救护以及严重病例的转介处理。校医院会把严重病例转介给相关的医疗机构，其中包括：巴里文打医院、双溪峇甲县医院、大山脚医院、诗布朗再也医院，以及先进医学与牙科研究所(IPPT)。
除了提供常规的医疗与牙科服务，校医院亦在校园公共卫生方面扮演着关键角色，包括控制传染病的传播、监督食堂卫生状况，以保障食品安全及整体校园社群的健康。
自成立以来，校医院历经多位单位主管的领导，名单如下：
• Dr. Mohammad Iqbal Omar (端洛校区, 1990–1998)
• Dr. Mohan (端洛校区, 1998–1999)
• Dr. Naeem Khan (端洛及高渊校区, 1999–2004)
• Dr. Menal A. Hamdi (高渊校区, 2005–2019)
• Dr. Farhi Abidin (高渊校区, 2019–现今)
秉持着关怀大学社群福祉的使命，校医院致力于推动校园社群的全面发展，涵盖生理、精神与社会适应等层面，全面配合USM追求卓越与可持续性发展的办学愿景。
